《工廠管理輔導法》上路4年，針對違法農地工廠祭出即報即拆、斷水斷電措施，然環團3日指出，近4年工廠占用農地面積，相當於243個大巨蛋，且占用面積每年增加，然政府裁處斷水斷電數量過低，更有工廠取得特登後多次汙染環境，要求賴政府制定更好的農地違章工廠退場機制。
工輔法規定，2022年3月19日前未依法納管的農地工廠，將斷水斷電，2016年5月20日後新增建的農地工廠應即報即拆。
但地球公民基金會專員賴沛蓮指出，根據「g0v台灣零時政府社群」開發「農地違章工廠回報系統」，他們2020年起至今收到3772件舉報，相當於每年收到近千件，再根據農業部農地及農業資源盤查結果，近4年遭工廠占用農地面積累計2433公頃，相當於243個大巨蛋，顯然農地違章工廠數量持續攀升，農地繼續流失。
她也引用經濟部數據，發現全台經發單位共查處6427間疑似農地工廠，其中僅283件被處以斷水斷電、215件處以罰鍰，裁罰不確實，無法阻嚇農地工廠增建，要求內政部督導地方政府，依《區域計畫法》或《都市計畫法》連續裁罰違法土地使用者，促使農地工廠拆除違建，經濟部也應立即斷水斷電、拆除未納管或新增建的農地工廠。
綠色公民行動聯盟副秘書長曾虹文則表示，2010年至去年為止，共227筆農地工廠涉及汙染被開罰，而且違規筆數隨著納管數量增加而增加，當中28家取得特登後因汙染行為被裁罰2次以上，代表農地工廠根本不怕被罰，甚至台中市某工廠取得特登後持續偷排廢水，當時被罰204萬並勒令停工，改善後依然持續營業。
曾虹文強調，根據工輔法，只要環保單位作出勒令歇業處分，即可撤銷工廠登記證，然實務上環保單位幾乎不會做出這樣的處分，就算排放有毒廢水，頂多是勒令停工，呼籲經濟部儘速制訂出一套有效遏止汙染的農地工廠退場機制，不要再踢皮球給環境部、打假球。