花東地區有機稻米生產面積約1788公頃，占全國52％，農糧署東區分署為健全花東有機農業生產鏈，與各農業單位成立有機水稻種苗場輔導團隊，輔導業者建置有機種苗生產系統，目前已有3家業者通過有機種苗驗證，其中花蓮2家、台東1家，每期作共可生產約4.8萬盤有機水稻種苗，預計能供應約190公頃有機水稻種苗需求。
農糧署東區分署表示，花東地區是國內重要的有機稻米產區，為健全花東有機農業生產鏈，依「花東地區有機農業發展計畫（第三期）」，邀集花蓮區農業改良場、台東區農業改良場、花蓮縣政府、台東縣政府及國立宜蘭大學，成立有機水稻種苗場輔導團隊，前往花東地區水稻育苗地點實地輔導，協助業者建置有機種苗生產系統。
經機水稻種苗場輔導團隊實地輔導後，花東地區目前共有3家水稻種苗業者通過有機種苗驗證，其中位在花蓮縣富里鄉的學田育苗行去年底通過有機種（子）苗驗證，是全台首座有機水稻種苗場，台東縣南島種苗場及花蓮縣有限責任花蓮縣銀川有機農產品生產合作社，則分別在今年5月通過有機水稻種苗驗證。
農糧署東區分署指出，3家通過驗證的有機水稻種苗場，每期作生產約4萬8000盤有機水稻種苗，總計可供應約190公頃有機水稻種苗需求，未來將根據市場需求逐步擴大生產能力。
農糧署東區分署表示，有機水稻種苗不僅有助於環境保護和土壤健康，也提供更安全、更可靠的農產品，滿足現代消費者對健康和環境永續的要求，且協助花東地區水稻育苗業者建置有機種苗生產系統後，也能完成從育苗到收成，全程有機種植的最後一哩路。