依據中央氣象署預報資料，「山陀兒」颱風影響南部以2、3日最劇烈，台南市政府針對土石流警戒區撤離621人，預警性封閉17座橋梁，37座抽水站啟動抽水，總抽水量約104萬噸，移動式抽水機佈設494台，嚴防再現嚴重積水災情。
台南市政府於1日上午8時將災害應變中心提升為一級開設，市長黃偉哲2日上午主持工作會報並與行政長卓榮泰進行視訊連線，報告台南防汛整備情況。
水利局指出，已完成巡查165條區域排水路及在建工程，其中，凱米颱風造成八掌溪左岸損壞部分已由經濟部水利署第五河川分署搶修完成，沿岸水門經巡查功能正常，市府也於八掌溪周邊預佈移動式抽水機共30台總抽水量每秒9.8立方公尺，再加上後鎮、菁寮2座大型抽水站總抽水量每秒17立方公尺。
水利局表示，後壁區下茄苳排水、後鎮排水、菁寮排水南岸及鹽水區岸內排水番仔寮等受損堤岸搶險工程之防汛缺口已防堵完成。 水利局指出，轄內64座抽水站已完成巡檢、油料補充及試運轉作業，妥善率達100％，另為避免因電力因素造成抽水站無法運作，已全面備妥發電機設備因應，針對易積淹水區域除已預佈494台大型移動式抽水機，並先向第四河川分署請求支援3台移動式抽水機預佈於鹽水地區。
為避免颱風拉高沿海潮位造成海水倒灌，水利局於安平區運河旁低窪處裝設舌閥32處並封堵側溝連通管，同時預佈10部移動式抽水機協助抽排內水。
水利局及各區公所備妥約23萬砂包及防汛塊約1000塊，並將約3600片防水擋板分發給區公所及自主防災社區，視天氣及實際狀況使用，並通知45處水患及16處土石流自主防災社區啟動防汛應變，全力投入防颱。
市長黃偉哲市長籲請市民朋友多加利用台南市政府官方Line群組、「台南水情即時通APP」，隨時瞭解水情狀況，及時防災、避災。